Ante la necesidad de situar al IBBA en el contexto internacional, el año 1997 se creó el laboratorio de Biología Celular y Molecular, cuyo objetivo principal fue introducir la biología molecular en estudios de fisiología y fisiopatología de altura para la aplicación en investigación bioquímica y genética que refleja una tendencia, hacia el enfoque molecular de las enfermedades como ultimo referente en la interpretación de procesos patológicos, y un futuro promisorio en nuevas estrategias diagnósticas y terapéuticas basadas en dichos avances.

Los estudios iniciales estuvieron dirigidos a las enzimas de diferentes tejidos de animales de laboratorio expuestos crónicamente a la altura. Gracias a la Cooperación Francesa, el laboratorio cuenta con el equipo y tecnología adecuados para esta área (Amplificador de PCR. HYBAI, Centrifugadora atemperada Maratón 26 KMR FISHER CIENTIFIC, Equipo de foto informatizado KODAK, Espectrofotómetro uv-visible ULTROSPEC, Cubetas de electroforesis para DNA Y RNA EMBI TEC, Equipo de electroforesis para proteínas y western blot BIO RAD. Actualmente la unidad trabaja en el estudio de haplotipos en poblaciones de altura y se tiene previsto continuar con el estudio del fenotipo muscular en ratas adaptadas a la altura.