Durante los primeros años de su existencia y gracias al acuerdo del Cooperación entre los gobiernos de Bolivia y Francia para el funcionamiento del I.B.B.A., vigente desde el año 2003, misiones de investigadores provenientes de Universidades Francesas, llegaron con la finalidad de asesorar a personal boliviano y otorgar el necesario equipamiento donado por universidades y laboratorios franceses, para el inicio de actividades, con participación de jóvenes profesionales bolivianos que fueron formados en Francia. Durante este período, en el que se nombró al Dr. Jorge Ergueta Collao como primer Director Boliviano (1965), se trabajó arduamente en las disciplinas de la Antropología, Hemotipología, Hematología, Bioquímica, Fisiología respiratoria, Cardiología, Neurofisiología, Inmunología, Embriología y Ejercicio Muscular, con la finalidad de determinar los valores de referencia para el habitante de la altura, habiéndose instalado por primera vez en el país, los laboratorio y gabinetes en los campos Respiratorio y Cardiológico, cuyos resultados permitieron el desarrollo de la cirugía cardiopulmonar en el medio. En los campos de Parasitología (Leishmaniasis, Chagas), la Farmacognosia y la Nutrición se efectuaron importantes trabajos de aplicación local e interés internacional. Los valores obtenidos en las diferentes disciplinas, constituyen parámetros de referencia para la atención de pacientes en nuestro medio, evitando así valoraciones en función a parámetros obtenidos a nivel del mar.